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Personnellement j'ai choisi la fin "verte", la synthèse organique-machine. C'est celle qui me parait la plus probable, en tout cas la plus intéressante et la plus en rapport avec ma partie, ma Shepardette étant un personnage ultra-positif (dans chacun des ME, ma barre bleue est à fond en fin de jeu, autant dire que j'essaie vraiment d'incarner le héros parfait). Alors c'est peut-être de là que vient une incompréhension de certains, ils ont peut-être plus suivi leur coeur durant l'aventure, se permettant plusieurs décisions très pragmatiques, m'enfin...
S'il fallait vraiment taper sur les doigts de Bioware, je crois que ce serait plutôt sur le destin des personnages qui nous entourent, que ce soit nos équipiers, les membres de l'équipage ou les figures importantes de la saga. A part pour un ou deux, on ne sait pas trop ce qu'ils deviennent une fois le jeu terminé.
Autre point un peu ennuyeux, je pense que Bioware a été victime de l'ampleur de son projet: en effet, les choix importants de ME1 et 2 ne semblent pas peser aussi lourds qu'ils le devraient, au final. Exemple tout bête, la reine Rachni sauvée dans ME1,si ce n'est proposer une mission dans le 3 et apporter quelques ressources militaires non vues en action, est clairement décevante.

Reste que pour moi, la fin se tient bien, mettant fin (justement!) à ces tensions et ces guerres meurtrières entre organiques et machines, rompant de fait le cycle des moissonneurs. Ça n'empêche pas de supposer qu'une autre forme de vie dont on n'avait pas idée viendra bouleverser l'équation des millions d'années après, hein, mais ça pose une vraie fin, en somme.
J'ai d'ailleurs l'impression que beaucoup reprochent au jeu de ne pas se terminer par LE happy-end classique: le héros et ses amis en train de fêter la victoire devant la paix revenue. Certains devaient vraiment s'attendre à voir Shepard siroter son cocktail au bord de la mer en fin de jeu! Un peu à contre-courant de l'esprit du jeu, non?

Reste le cas de cette théorie intéressante qui circule, comme quoi tout serait factice en fin de jeu, Shepard ayant été endoctriné et ne faisant qu'un choix illusoire, dicté par les moissonneurs, qui arriveraient donc à leurs fins en nous trompant. Mouais, j'y crois moyen et tous les "indices" relevés sont attaquables, même si durs à complètement réfuter. Dans ces cas-là, c'est vraiment le ressenti du joueur qui va mettre en lumière la fin qu'il valide, celle qu'il ressent viscéralement comme étant la bonne, chacun amenant donc son expérience et son vécu dans sa vision des choses.

Je m'attarderais peu sur les autres fins proposées. Je ne les ai pas vues, j'ai juste lu leur développement sur le net. Elles me paraissent totalement à l'opposé de mon personnage, de ses valeurs et de ses choix, et n'ont donc pas grâce à mes yeux. Et finalement, c'est peut-être quand même un signe de réussite de Bioware: proposer des destins radicalement différents, pouvant convenir à tout type de joueur, même si, il faut bien l'avouer, il est un peu dommage que l'impact des choix des deux premiers épisodes soit si peu importants au final.